Takashi Natsume terus melanjutkan perjalanannya bersama Madara untuk membebaskan youkai dari kontrak dalam "Buku Teman". Seiring waktu, Natsume mulai menerima kemampuannya melihat youkai bukan sebagai kutukan, melainkan sebagai anugerah. Bersama teman-teman manusia dan youkainya, dia belajar bahwa kebahagiaan bisa ditemukan di kedua dunia.
