Từng coi khả năng nhìn thấy yêu quái là lời nguyền, nay Natsume đã trưởng thành và hình thành những mối quan hệ bền chặt với cả con người lẫn yêu quái. Cùng với Madara (Nyanko-sensei) - vệ sĩ tinh linh của mình, Natsume tiếp tục nhiệm vụ trả lại tên cho các linh hồn trong Sổ Tay Bạn Bùa - di vật của bà Reiko. Khi ngày càng nhiều yêu quái kỳ lạ tìm đến, Natsume nhận ra mình vẫn còn nhiều điều phải học về thế giới xung quanh.
