Japonya tarafından geliştirilen Infinite Stratos (IS) adlı dış iskelet silahını sadece kadınlar kullanabilir. 15 yaşındaki Ichika Orimura, bu silahı kullanabilen tek erkek olduğu için kızların okuduğu Infinite Stratos Akademisi'ne kaydolmak zorunda kalır. Burada çocukluk arkadaşlarıyla yeniden bir araya gelen Ichika, ablası Chifuyu'nun rehberliğinde tehlikelere karşı mücadele edecektir.
