Lise öğrencisi ve dahi dedektif Shinichi Kudou, gizemli bir suç örgütü tarafından deneysel bir ilaca maruz bırakılır ve yedi yaşında bir çocuğa dönüşür. Gerçek kimliğini gizleyerek Conan Edogawa adını alır ve çocukluk arkadaşı Ran ile babası dedektif Kogorou'nun yanında yaşamaya başlar. Gizliden gizliye davaları çözerken, kendisini bu hale getiren örgütü araştırmaya devam eder.
