
শিনরা কুসাকাবে এবং আর্থার বয়েল কোম্পানি ৮-এ ফিরে এসে discovers যে তাদের ক্যাপ্টেন গ্রেপ্তার হয়েছে। হোয়াইট-ক্ল্যাড কাল্ট টোকিও সাম্রাজ্যের নিয়ন্ত্রণ নিয়েছে এবং ফায়ার ফোর্সের ভিতরে infiltrate করেছে। শিনরা এবং তার দলকে বিদ্রোহী হিসেবে চিহ্নিত করা হয় যখন তারা তাদের ক্যাপ্টেনকে বাঁচানোর এবং টোকিওকে মুক্ত করার Mission শুরু করে।