শিনিচি কুডো একজন প্রতিভাবান হাইস্কুল গোয়েন্দা। একদিন একটি অপরাধী সংগঠন তাকে পরীক্ষামূলক ওষুধ খাওয়ায়, যার ফলে সে সাত বছর বয়সী শিশুতে পরিণত হয়। এখন 'কনান এডোগাওয়া' নাম নিয়ে সে তার বন্ধু রানের বাবা কোগোরোর পিছনে থেকে মামলা সমাধান করে।同时 সে সেই সংগঠনকে খুঁজছে যারা তাকে এই অবস্থায় ফেলেছে।
