দশ বছর বয়সী সাকুরা কিনোমোটো একদিন 'দ্য ক্লো' নামের রহস্যময় কার্ডের বই খুঁজে পায়। দুর্ঘটনাবশত সে সব কার্ড শহরজুড়ে ছড়িয়ে দেয়। কার্ডের রক্ষক কেরোবেরোস তাকে বলে যে এই শক্তিশালী ক্লো কার্ডগুলো এখন বিপজ্জনক। সাকুরাকে এখন কার্ডক্যাপ্টর হয়ে সব কার্ড ফিরে পেতে হবে।
