شينيتشي كودو، التلميذ الثانوي والمحقق العبقري، يُجبر على تناول دواء تجريبي من قبل منظمة إجرامية غامضة، مما يحوله إلى طفل في السابعة من عمره. بإخفاء هويته الحقيقية واتخاذ اسم كونان إيدوغاوا، يعيش مع صديقة طفولته ران وأبيها المحقق كوغورو. بينما يحل القضايا خلف الكواليس، يبحث كونان أيضًا عن المنظمة التي تسببت في وضعه الحالي.
